1966년 2월 28일에 설치된 후 34회의 직제개편을 거쳐 1997년 8월 현재 8국 22과와 세무공무원교육원과 기술연구소를 두고 있으며, 청장은 차관급의 정무직이고, 1급의 차장 1명을 두고 있다.
슬롯 머신 방법청장 소속하에 7개 지방슬롯 머신 방법청(서울·인천·중부·부산·대구·대전·광주)이 있고, 지방슬롯 머신 방법청장 소속하에 세무서(115개) 및 지서(4개)가 있다. 본청 조직으로 총무과와 징세심사국·직세국·간세국·국제조세국·조사국이 있고, 청장 밑에 공보담당관, 차장 밑에 기획관리관·자료관리관·감사관 각 1명이 있다.