악안면성형재건외과학의 발전과 국민보건증진을 위해 오재인(吳在仁) · 정순경(鄭淳慶) · 이열희(李烈熙) 등이 중심이 되어 1962년 11월 서울에서 설립되었다.
1975년에 대한구강외과학회와 공동으로 학술대회를 개최하였다. 1978년에는 학회지 『顎顔面成形外科』를 창간하였다. 1981년에는 대한치주과학회와 공동으로 제1회 심포지움 개최하였다. 1989년에는 학회 명칭을 대한악안면성형재건외과학회(Korean Academy of Maxillofacial Plastic and Reconstructive Surgry)로 개칭하였다.
1998년에는 학회의 영문 명칭을 Korean association of Maxillofacial Plastic and Reconstructive Surgeons로 바꾸었다. 2004년에는 학회지가 슬롯 머신 잭팟연구재단 등재학술지에 선정되었다. 2006년에는 기타규슈에서 열린 '제 51차 일본구강외과학회'에 참가하였고, 2011년에는 일본악변형증학회와 자매결연 10주년 행사를 일본에서 개최하였다. 2014년에는 Maxillofacial Plastic and Reconstructive Surgery로 학회지명을 변경하고 출판사를 스프링거로 이관하여 온라인으로 출판을 시작하였다. 2018년에는 JSJD (일본악변형증학회) 학술대회에 참석하였다. 2021년에는 오스템임플란트(주)와 MOU를 체결하였고, 학회 창립 60주년 기념식을 개최하였다.
1985년부터는 최근에 개발된 수술방법 등 흥미 있는 주제를 가지고 심포지엄을 개최하고 있으며, 국제학술교류를 위하여 일본의 악안면보철학회(顎顔面補綴學會)와 학술지 교류 등을 하고 있다. 학술지 Maxillofacial Plastic Reconstructive Surgery를 발간하고 있는데, 이 학술지는 SCOPUS에도 등재되었다. 매년 베트남 등지에서 무료 봉사활동을 하고 있다. 학회 사무실은 서울특별시 성동구 송정동 대한치과의사협회 내에 있다.