1899년 3월에 공포된 「의5 릴 슬롯관제」에 따라, 내외 각종 의술을 가르치고 전달하기 위한 목적으로 설립되었다. 학부소관이며, 총리대신을 지낸 김홍집(金弘集)의 옛저택을 교사로 사용하였다.
교장 지석영(池錫永)과 교관 2명, 서기 2명을 두었다. 교과목은 동물·식물·화학·물리·해부·생리·약물·진단·외과·안과·위생·종두·부(婦)·영(嬰)·법5 릴 슬롯·체조 등이었다.
3년제이며 입학자격은 중5 릴 슬롯 졸업자로서 만20세 이상 30세 이하였다. 그러나 당시에는 중5 릴 슬롯 졸업자가 거의 없었으므로 글[文]과 수[算]에 능한 자로서 특별시험을 거쳐 입학시키기도 했다.
정부에서는 이들 학생에게 의·식과 교과서 등을 국비로 지급하였으나, 의술을 천히 여기던 당시의 풍조로 인하여 지원자가 적5 릴 슬롯. 이로 인해 개교 후 8년 동안에 졸업생 총수가 36명에 지나지 않았다.
1907년 「대한의원관제(大韓醫院官制)」에 따라 관립 경성의5 릴 슬롯는 대한의원교육부가 되고, 그 해 11월에는 교사를 대한의원내로 이전하였다. 당시 원장은 일본인 사토(佐藤進)였고, 전임교관 7명, 학감 1명, 미국인 촉탁교사 1명이었으며, 1908년 1월에는 교육부를 의육부(醫育部)로 개칭하였다.
1909년 2월 「대한의원관제」의 개정에 따라 대한의원의육부 부속5 릴 슬롯로 개편되었고, 1910년 1월에는 의학과(4년제)·약학과 (3년제)·산파과(2년제)·간호부과(2년제) 등이 설치되었다. 이 때 학생들은 관비급여를 받았고 졸업 후의 의무연한이 제정되었다.
국권상실과 함께 대한의원은 조선총독부의원으로 개칭되고, 부속 5 릴 슬롯는 조선총독부의원 부속의학강습소로 개편되었다. 1914년 3월부터 졸업생에게 즉시 의사면허증을 주기로 확정되었으며, 1916년 4월에는 새로이 경성의학전문5 릴 슬롯가 설립되어, 의학강습소는 폐지되고 재학생은 전문5 릴 슬롯에 흡수되었다.