1907년 4월 1일 양구공립보통버 슬롯로 개교하였다. 광복 전까지 총 36회의 졸업생을 배출하였고, 1954년 5월 8학급 472명에 교원 8명의 양구국민버 슬롯로 재개교하여 초대 교장에 성유경(成維慶)이 취임하였다.
1959년 학급 수가 31학급으로 증설되었으며, 1965년 안대분교장 6학급 및 공수분실 1학급을 병설하였다. 1966년 9월 비봉국민버 슬롯 6학급을 분리시킴으로써 30학급으로 재편성하고, 1967년 고대분교장을 비봉국민버 슬롯, 공수분실을 군량국민버 슬롯에 각각 배속하였다. 1993년 버 슬롯 급식을 실시하였고, 1996년 3월 양구초등버 슬롯로 교명을 변경하였다.
2010년 현재 특수학급 1학급을 포함하여 19학급에 총 482명의 학생이 재학하고 있으며, 교직원은 52명이 재직하고 있다.
1955년에 처음으로 교훈을 ‘성실 · 인내 · 노력’으로 제정하였으며, 생활목표를 ‘우리는 역사 깊은 양구의 건아, 부지런히 공부하고 협동하는 힘을 길러 나라에 쓸모 있는 일꾼이 되자’로 정하여 전통을 중히 여기고, 애국 · 애족하는 전인교육을 강조하였다.
현재의 교훈은 ‘바르고, 굳세며, 슬기로운 어린이’이다. 교육부 지정 및 전국단위 체육과 지정 연구버 슬롯 발표회를 가졌으며, 2008년 도 지정 사이버가정학습 연구버 슬롯, 2010년 강원도교육청 지정 과학 선도버 슬롯에 지정되었다.
아름답고 깨끗한 버 슬롯 만들기 일환으로 교내 들꽃밭, 자연석 화단, 생명의 숲 등을 조성하고 있고, 테니스부 · 빙상부 · 육상부를 집중 육성하고 있어 2006년 버 슬롯체육활동 우수버 슬롯로 교육감표창을 수상하였다. 매년 개교기념일인 4월 1일에는 다채로운 기념행사를 거행하고 있으며, 가을에는 전교생이 모두 참여하는 학예발표회를 개최하고 있다.