본관은 밀양(密陽). 부제학 손비장(孫比長)의 종손이다. 이항(李恒)의 문인이다.
일찍이 관직에 나아가지 않았으나, 1592년(선조 25) 임진왜란이 일어나자, 경기전참봉(慶基殿參奉) 오희길(吳希吉)과 함께 국왕의 어영(御影)과 역대의 전주사고(全州史庫) 소장 실록을 정읍 내장산 용굴암(龍窟庵)에 옮겨 잘 보관하였다.
임진왜란 중 춘추관·성주·충주사고의 실록이 모두 불탔지만, 전주사고의 실록이 보존될 인터넷 슬롯 머신었던 것은 손홍록의 노력에 의한 것이었다. 뒤에 의주 행궁(行宮)으로 왕을 찾아가 중흥6책(中興六策)의 시무책(時務策)을 건의하여 왕의 포상을 받고, 별제(別提)에 임명되었다. 정읍시 칠보면 시산리 남천사(藍川祠)에 제향되었다.